Взрыв таинственной рэйацу прогремел в Сообществе душ, в самом центре Сэйрэтэя, вызвав крупные разрушения. В то же время Рукию Кучики поразило изменение, заставившее её утратить нечто важное внутри себя. Киске Урахара отправляет Ичиго Куросаки в Сообщество душ, чтобы разобраться в происходящем.
Достигнув Сэйрэтэя, Ичиго подвергся нападению синигами, когда-то бывших ему союзниками. Но сейчас они забыли и о нём, и о Рукии. И теперь, в одиночку скрываясь от ареста, Ичиго должен отыскать Рукию и раскрыть причины мистического проишествия, пока еще не слишком поздно.

Группой подозрительных лиц во время транспортировки в Общество Душ был украден ценный артефакт - "Королевская печать". Хицугая Тоширо, капитан 10 отряда, возглавляя транспортировку, ввязался в схватку с лидером похитителей, а затем пропал без вести. В результате Сейрейтеи объявляет Хицугаю предателем и издает приказ изловить его и казнить. Куросаки Ичиго отказывается верить в это, и вместе с Мацумото Рангику, Кучики Рукией и Абараи Ренджи клянется найти настоящего инициатора похищения и очистить имя Хицугаи. В это время сам Хицугая ведет поиски похитителей печати и узнает страшный секрет шинигами, которого уже давно считали погибшим.

Однажды в Каракуре произошел следующий случай. В городе появилась группа созданий, именуемых «полыми». Рукиа и Итиго отправились в разведку, по пути обнаружив еще одну синигами Сэнну. Впрочем, помимо имени ее меча, никакой больше информации о ней нет. О принадлежности к какому-либо отряду она также не упоминает.
В Обществе Душ также неспокойно. В небе над Сэйрэтэй образовалась проекция мира живых. Объявлено чрезвычайное положение, проводится срочное расследование данного случая. Для некоторых синигами это событие послужило знаком приближающегося конца. Если баланс между Обществом Душ и реальным миром пошатнется, оба мира могут пострадать. Тем временем, Тосиро Хицугая получает специальный приказ…
Итиго и Сенна обнаруживают группу людей, называющих себя «Тёмными». Их лидер Ганрю одержим идеей уничтожения мира. По мере того, как сила Тёмных растет, Итиго и его друзьям предстоят все более тяжелые и значимые битвы. Также неизвестно, почему Темные преследуют Сэнну. На все у героев есть только час, час до конца мира. Битва между синигами и Темными уже началась. Отсчет пошел…